Bank Data Protein (PDB)[1] ialah pangkalan data untuk data struktur tiga dimensi bagi molekul biologi yang besar, seperti protein dan asid nukleik. Data yang biasanya diperoleh melalui kristalografi sinar-X, spektroskopi NMR, atau sejak kebelakangan ini, mikroskop krioelektron, dan diserahkan oleh ahli biologi dan biokimia dari seluruh dunia, boleh diakses secara bebas di Internet melalui laman web organisasi ahlinya (PDBe,[2] PDBj,[3] RCSB[4] dan BMRB[5]). PDB diawasi oleh organisasi yang dipanggil Worldwide Protein Data Bank, wwPDB.PDB ialah kunci dalam bidang biologi struktur seperti genomik struktur. Kebanyakan jurnal saintifik utama dan beberapa agensi pembiayaan kini memerlukan saintis menyerahkan data struktur mereka kepada PDB. Banyak pangkalan data lain menggunakan struktur protein yang disimpan dalam PDB. Sebagai contoh, SCOP dan CATH mengelaskan struktur protein, manakala PDBsum menyediakan gambaran keseluruhan grafik entri PDB menggunakan maklumat daripada sumber lain seperti Gene Ontology.[6][7]